Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms