Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms