Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNQ3O43525 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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