Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYNJ1O43426 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYNJ1O43426 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms