Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1D1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1D1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1D1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1D1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms