Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PRRT4C9JH25 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms