Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms