Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSPB2A8KAH6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB2A8KAH6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms