Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms