Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms