Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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SNX13Q9Y5W8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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SNX13Q9Y5W8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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SNX13Q9Y5W8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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SNX13Q9Y5W8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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SNX13Q9Y5W8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SNX13Q9Y5W8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SNX13Q9Y5W8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SNX13Q9Y5W8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SNX13Q9Y5W8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SNX13Q9Y5W8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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