Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REXO2Q9Y3B8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REXO2Q9Y3B8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms