Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RNF6Q9Y252 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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RNF6Q9Y252 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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RNF6Q9Y252 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RNF6Q9Y252 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RNF6Q9Y252 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RNF6Q9Y252 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RNF6Q9Y252 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RNF6Q9Y252 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RNF6Q9Y252 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF6Q9Y252 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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