Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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