Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms