Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms