Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL42Q9P2K6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms