Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms