Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF275Q9NSD4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms