Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEPEQ9NQ76 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms