Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms