Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NRDE2Q9H7Z3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms