Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms