Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms