Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIPCQ9C0C6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms