Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms