Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms