Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms