Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms