Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms