Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFHD1Q9BUP0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms