Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms