Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF2Q99805 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms