Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms