Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAM1Q96QH2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms