Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms