Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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