Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
KCNH8Q96L42 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH8Q96L42 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms