Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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