Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRIQ1Q96JM4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms