Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms