Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms