Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAF2Q96CS3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms