Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKD2Q969F2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms