Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL3LQ92901 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms