Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDAQ92838 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EDAQ92838 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDAQ92838 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDAQ92838 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDAQ92838 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDAQ92838 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDAQ92838 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EDAQ92838 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDAQ92838 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDAQ92838 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDAQ92838 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDAQ92838 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDAQ92838 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDAQ92838 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EDAQ92838 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms