Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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CHTF18Q8WVB6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTF18Q8WVB6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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