Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL22A1Q8NFW1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms