Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms