Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11FIP4Q86YS3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB11FIP4Q86YS3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB11FIP4Q86YS3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB11FIP4Q86YS3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB11FIP4Q86YS3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB11FIP4Q86YS3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB11FIP4Q86YS3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB11FIP4Q86YS3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms